Los mismo es hacerlo directamente desde el recovery que desde la aplicación CWM, porque cuando mandas hacerlo desde esta aplicación ella sola cambia el movil a modo recovery, hace el backup y reinicia el teléfono con normalidad. El resultado es el mismo pero automatizado. La aplicación CWM es un simple gestor del CWM recovery, esa aplicación no sirve para nada si no tienes el recovery instalado...
