1 Para el caso es o son lo mismo si acaso puedes llamar Firmware al oficial y Rom al firm cocinado. Pero en definitiva da lo mismo.
2 Más de lo mismo el ClockWorkMod es un Recovery Alternativo que permite la carga de Roms y manejo de otras funciones avanzadas. El Recovery de serie es muy limitado y te servira para hacerle un hard reset o recuperar tu movil llegado el caso, son lo mismo pero los modificados permiten hacer mas cosas...
3 Los Modems o Radios suelen ser indistintos y no tienen porque dar incompatibilidades.
Con lo que tienes que tener algo más de cuidado son con los kernels (no suelen haber incompatibilidades) y las modificaciones que hagas a efectos visuales, estas ultimas si tiene que ser especificas para una determinada ROM.
Salu2