Dónde indica eso Samsung? No recuerdo haberlo visto en las indicaciones que aparecen al encender el teléfono por primera vez.
Suerte entonces que yo de las 4 veces que lo he cargado, sólo lo he cargado cerrado una vez...
Lo único que se me ocurre que pueda verse afectado es la temperatura del móvil, ya que al cargarse cerrado, tiene menos superficie de contacto con el aire y sube su temperatura, lo cual degrada la batería más rápido. Pero vaya, que no lo sé, es la primera posible razón que se me ha venido a la cabeza.