Nah, sin miedo, no hay riesgo, en caso de que pasara lo peor, es tan simple como volver a meter el bootanimation.zip en la carpeta correspondiente desde el recovery
EDIT: Si tengo un momento me curro un flashable desde recovery
Vale, este funciona para CYANOGEN, flashear desde el Recovery y listo:
http://dl.dropbox.com/u/13036059/ZSc...1/AnimCyan.zip
yyy este otro deberia funcionar para Sense
http://dl.dropbox.com/u/13036059/ZSc...1/AnimSens.zip