Es posible que hayas intentado flashear un kernel que no es para tu terminal. Supongo que estás con la Onecosmic...qué kernel le fuiste a poner?
Se te queda en Setup Connection porque no tienes los drivers correctamente instalados.
Para solucionar esto, cierra Odin y conecta el teléfono al PC en modo donwload. Te aparecerá el cartel de que está instalando controladores. Cuando termine, desconectas y reinicias el ordenador y el teléfono (estando en download haces el combo para volver a entrar en download, es para que se reinicie el teléfono.
Cuando se reinicie el PC, abres el Odin y pones los archivos de la stock rom que quieras meter. Conectas el teléfono en el mismo puerto que hiciste la operación anterior (esto es muy importante), y prueba, debería funcionar