1. En principio no afecta, es más si quieres lo puedes liberar hay más de un manual en este mismo foro
2. Para poder hacer una copia de la carpeta efs has de ser root que no es más que ser superuser en Windows y poder acceder a las carpetas de sistema. La carpeta efs contiene el imei tu dirección wifi y alguna cosa más que es información única de tu terminal así que vale la pena guardarse una copia.
Hacerse root no cambia el imei se supone, pero cambiar de rom o liberar puede. Primero te haces root luego haces una copia de efs con un explorador de archivos que te permita root u otro método, asegurarte de tener acceso al modo recovery y download y después ya puedes seguir cualquier manual de actualización y demás.
Me dejo cosas seguro pero más o menos es este orden, lee por este foro empapate un poco de todos estos temas y el miedo a flashear y demás se pierde rápido.
Hay temas fijos con toda la información, pero en tapatalk si lo usas están en una pestaña y se quedan en el olvido.
Ánimo