Para empezar el reproductor del touchflo es malo con avaricia, el orden de las canciones a veces es de chiste como las coge, por muy "mucho" que esten editados bien los idtag. Asi que lo de que te salga en un programa si y en el touchflo no, no te preocupes.
Lo de que te salga la caratula con una sola cancion si es posible, de hecho hay forma de asignar dentro del mp3 las caratulas que yo sepa, creo que con el tag&rename y la opcion cover file art se podia por ejemplo.
Saludos!