Gracias Golfo. Te me adelantaste. Acabo de entrar en la pagina de Microsoft y esto es lo que dice acerca del archivo NETCFSetupv35.MSI: "Este paquete usa ActiveSync 4.0 para actualizar el dispositivo. Antes de ejecutar el archivo NETCFSetupv35.msi, conecte el dispositivo a su PC. Si el dispositivo no está conectado, ActiveSync almacenará el archivo CAB y no instalará el paquete hasta que lo conecte. Si no usa ActiveSync, ejecute los archivos CAB del dispositivo correspondientes a archivos CAB específicos de dicho dispositivo que encontrará en la carpeta de instalación."
Asi que esa es la forma de instalar. Cuando instala el cab dice que ocupa 6.7 Mb aprox.
Termine de instalar el .net framework y el Advanced Configuration Tool funciona de maravillas.
Gracias y espero que este post le sirva a algun otro neofito del tema mientras transitamos este camiono de aprendizaje.