En principio, pierdes todo lo que dependa de knox, y tendrás que ir peleando con parches para poder seguir usando otras apps que dependen del sistema "Play Integrity".
En la práctica, ahora mismo yo tengo el móvil rooteado y me funciona todo sin más complicaciones, salvo Samsung Pay. Para todo lo demás, hay parches que se instalan como módulos de magisk y lsposed y listo.