Hombre, yo tengo esa misma ROM y no he tenido ningún tipo de problemas a la hora de recibir llamadas mientras estoy conectado a 3G o HSPA.
Otra cosa que se me ocurre, es que aunque le tengas puesto GSM/WCDA en Preferencias de red, justo donde te sucedió sólo tuvieras cobertura de 2G y al estar chateando con el whatsapp no permitiera la entrada de llamadas de voz.