Yo tengo la última versión del emulador n64oid y he probado las roms Zelda OOT,Super Mario 64 y Super Smash Bros y van perfectamente.
Mírate en este post,prueba la última versión y si no te va,pregunta allí,sabrán que decirte:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=189229
Un saludo!