Qué putada, eso me imagino también, que dará igual la versión que saquen. La primera instalación desde la 3.3 va a tener que ser limpia si vienes de otra anterior a ésta. Sin embargo, desde la 3.3 que ya incorpora lo del tema de los permisos, si actualizas en sucio a 3.4 o superior no pasará nada imagino...
Un saludo!