Hola,

A mi me pasa exactamente lo mismo. Compré una SD de 16Gb clase 6 y como me daba este problema me volví a comprar otra y me sigue haciendo lo mismo.
He probado con diferentes Kernels y ROM's y formateando desde la HTC y desde el PC.
Suele funcionar mientras el movil no hace uso de la tarjeta. Si por ejemplo, escucho música,a los segundos me aparece el mensaje "la tarjeta se ha desconectado inesperadamente".
Al final he vuelto a poner la original. Empiezo a pensar que comprar microSD baratas por Ebay acaba saliendo caro.