Los "datos del sistema" los gestiona iOS. No debes preocuparte.
Son caches y datos de aplicaicones eliminadas, pero no eliminados los datos, entre otras muchas cosas.
iOS irá vaciando cuando lo crea necesario.
Esos datos no se copian en la copia en iCoud ni en la copia en itunes.
De verdad que no deberías preocuparte por eso.
Saludos
