No estoy seguro de haber entendido bien lo que quieres decir, convendría que trataras de explicarte de forma algo más precisa.
La opción para activar la estabilización en la cámara de vídeo que hay en los ajustes de la cámara se refiere a la estabilización electrónica (EIS), mientras que lo que hace que la lente se mueva es la estabilización óptica (OIS). La OIS es un mecanismo físico y hasta donde yo conozco está siempre funcionando, no se puede activar o desactivar. La EIS es una opción que se realiza por software y se puede activar o desactivar salvo en ciertos modos que no lo admiten (grabación en UHD o en FHD a 60 FPS), posiblemente por limitaciones del procesador. Aparte de lo anterior está el modo ultraestable, que se activa mediante un icono específico que aparece en la parte superior de la interfaz cuando grabamos vídeo con la cámara principal o con la ultra gran angular, es también EIS y solo es compatible con la grabación en FHD a 30 FPS.
Por cierto, diría que el movimiento de la lente por el OIS es muy difícil de apreciar a simple vista. Acabo de hacer la prueba en mi A52s y sinceramente no acierto a distinguirlo, aunque he de reconocer que soy miope. Quizás sea eso lo que te despiste, crees que en algunos casos se mueve la lente y a lo mejor solo es un efecto óptico...
Saludos