Pues yo NUNCA he usado las copias de seguridad. (Según mi opinión y experiencia) ,ya que dejas el teléfono limpio como una patena, después del restablecimiento de fábrica, lo mejor es hacer una instalación LIMPIA de todas las aplicaciones.
Pero bueno, es mi humilde opinión y es así como yo lo hago. 0 problemas.
Un saludo,
Quimo