Depende de las carpetas
Si son del sistema te aconsejo que no las toques, de todas formas lo más seguro es que las vuelva a crear. Luego si son de apps que has quitado, elimínalas sin pensártelo.
Ahora saber algunas carpetas para que son a veces es un poco rollo. Yo personalmente llevo épocas que trasteo mucho, pero que mucho, con el teléfono instalo a saco ROMs y apps. Luego cuando ya me canso pues formateo me pongo un RUU y así aguanto muchísimo.