Hombre, agus, pues para gustos colores, como ya he dicho en post anteriores. Yo prefiero fluidez y para mí, ojo, para mí, noto un pelín más fluido el TW4.5, ya que llevo los dos launchers en el teléfono y puedo comparar.
En cuanto a configuración el TW4.5 no es tan configurable como el Launcher Pro, pero para la configuración que necesito me vale. Puedes poner 5 iconos en el dock, puedes poner 5 iconos en filas y columnas, puedes modificar el tamaño de los widgets para adaptarlos en la pantalla con solo tenerlos pulsados un rato y varias cosas más.
Te trato de responder a las preguntas:
La primera no sé muy bien a qué te refieres. Por defecto, las aplicaciones están configuradas en modo escritorio y no en lista. Si te refieres en lugar de verlas en vertical, verlas en horizontal, en transiciones de pantalla como el escritorio principal donde van los widgets y demás, con el TW4.5 las puedes ver en horizontal y con el Launcher Pro no he encontrado esa opción.
Carpetas puedes crearlas con varias apps del market, yo uso Application Folder. Pero si usas el TW4.5, no hace falta aplicación alguna, puedes crear carpetas en el escritorio de las aplicaciones. Otra función que yo no veo en el Launcher Pro.
Tampoco he encontrado esta opción con el Launcher Pro, el de serie. Sin embargo, y como ya sabes, el TW4.5 te permite ordenar las apps alfabéticamente o por orden de instalación.
De todas maneras parece que estoy vendiendo yo un producto como si me fuera a llevar comisión jejeje

. Que cada uno use lo que le apetezca yo para mis necesidades ya me decanté

