Hola! No hay que instalar Magisk ni ser root para que te funcionen los pagos y demás cosas.
A mí desde la primera xiaomi.eu que instalé, el dispositivo está certificado y nunca me ha dado un fallo GPay.
Sigue la guía del primer post que actualicé, con todos sus wipes y format data (si te da error, reinicia en twrp de nuevo y format data otra vez) e instala otra vez xiaomi.eu a ver.
Incluso probando Pixel Experience y crDroid me han funcionado los pagos sin problema, no hay que instalar Magisk ni rootear el teléfono.