No creo que tenga que ver... hay cientos de personas usando roms modificadas que no sufren estos problemas, de hecho una de las virtudes de muchos kernels no oficiales precisamente es la optimización de las duraciones de baterías con undervolting y demás.
Tiene que ser algo particular mío, algo que ocurra con 3G/HSDPA y no con WIFI...
Sabes cuántas horas de pantalla encendida tienes a lo largo del día?