Puedes descargarte la ROM oficial de la página de Xiaomi (siempre en versión .tgz), y utilizar el programa XiaoMIFlash, por ejemplo, para dejarlo de fábrica y con ROM oficial.
Eso si. Cuando abras ese programa, acuerdate de DESMARCAR la opción que viene marcada, por defecto, abajo del mismo (clean all and lock), y marcar la de clean all, para que así no se te cierre el bootloader.