No sé si asus será distinta en este sentido (me extraña) pero normalmente las compañías no te aceptan en garantía un dispositivo rooteado. Si solo está rooteado, y no has cambiado rom ni nada, será todo mucho más sencillo. El unroot es muy sencillo. Concretamente en la transformer no tengo ni idea de como se hace, porque no sé que metodo se sigue para rootearlo. Pero normalmente el método, o programa que hayas seguido para rootearlo te servirá para desrootearlo. Hazlo, a garantía y listo. Cuando te vuelva vuelves a rootearla ;)