puede que el formato que pasas el movil no sea el indicado,lo ideal para pasar los videos en 3d al movil es convertirlos a traves del handbrakes y pasarlos al mvl creando una carpeta llamada video e introduces ahí el/los videos convertidos y te los debe de reconocer en galeria.te paso un tuto por si fuera esto:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=260915
recuerda que cuando reproduzcas un video en 3d en el movil se vera doble,lo que tienes que hacer es darle a la tecla de menu y reproducir en 3d y luego aceptar y se te estara reproduciendo en 3d. saludos y espero que sea esto!