Segun mi experiencia (bastante grande xd) es imposible que te queden ficheros de una ROM anterior en la carpeta de windows a noser que flashees mal (lo dudo porque con mal me refiero a no cambiar la ROM) las partes que quedan probablemente no son visibles desde ninguna carpeta.
Toda la gente(menos una persona

) que tiene problemas raros y pone la version original y luego otra ROM cocinada se le arregla.
Que ficheros son los que te parece que se mantienen en la ROM?
Comentario:En cuanto a lo del hard reset despues de flashear en mi opinion es un mito.