A mí las notificaciones sí que me las silencia, pero no los sonidos del sistema como los de bloquear y desbloquear.
Además si tengo el modo no molestar y una alarma me suena, no puedo apagarla, tengo que desbloquear el dispositivo y bajar la barra de notificaciones...
Una vez se me solucionó con un Factory reset, pero acabó volviendo a pasar.