Solucionado. Perdonar por el post, pero llevábamos dos días así y empezaba a ser preocupante. El problema estaba en el kernel que estaba instalando no instalaba bien y me dejaba en semibreak, además de alguna otra cosilla que empeoraba la situación. Pero ahora ya tenemos el recovery de clockworkmod y podemos meter la cyanogen sin problemas.
Muchas gracias.