No es que te pida la clave, es que te pide que accedas a la carpeta segura para poder actualizar aplicaciones que hay allí (Google, Galería, etc)
No siempre lo pide, a veces al actualizar una app normalmente, también se actualiza la de carpeta segura.
Si actualizás desde carpeta segura, abajo a la derecha se ve el icono de que que estás actualizando desde la carpeta.