Como te han dicho, es solo tema de actualizar los binarios de la aplicacion que nos permite ser root, la Superusuario (Abrir aplicacion, boton de opciones, Preferencias, y abajo de todo "Su binaria", pulsa ahi para buscar actualizaciones). Ese mensaje de "Ha estado muy bien, vuelvelo a hacer" sale por defecto, pero con una ves que lo aprietes, te actualizará todo y el mensaje del "#" dejará de aparecer. Tambien puedes desmarcar la opcion de que te avise cuando el binario está atrasado, pero creo que entonces la aplicacion puede empezar a ir mal si no se actualiza.