Creo que estas un poco liao,el backup de aplicaciones y datos que haces con el titanium se guarda en una carpeta en la sd interna que se llama titaniumbackup,esa carpeta has de pasarla a la sd externa para flashear ya que si no se te borra,una vez que flashees vuelves a poner esa carpeta en la sd interna y bien con el titanium que te viene en la rom o con el que instales restauras el backup