He actualizado a la última versión de mayo (no sabía que se podía hacer sin borrar nada desde Recovery) y el problema de rotación sigue igual. No sé si es por el Chrome, que de vez en cuando se cuelga. Uso el navegador de Samsung, que también va bastante bien.
El S-Pen funciona, pero diría que ahora tengo que presionar más fuerte. No sé si ya era así con la versión anterior.
Por cierto, hay algo para eliminar el mensaje "Set warranty bit: kernel" al arrancar el Note 3? y para poner el knox a 0x0 (manías mías).