Buenas,
Antes de nada, de que BQ estamos hablando? ¿U o U plus?
Esta claro que la ROM stock no soporta exFAT con lo cual como indicas es necesario que el kernel lo soporte.
Flashear el kernel de Lineage Os (entiendo que te refieres al boot.img) lo único que provocará es que el móvil entre en un bootlop con el BOOTLOGO (BQ powered by android).
Si tienes el Aquaris U Plus existe un kernel pero desconozco si soporta exFAT. Aquí lo tienes:
https://www.htcmania.com/showthread.php?t=1362720
De todos modos lo más seguro es que no soporte exFAT aún instalando ese kernel.
Un saludo.