Primer lugar si tenes 3.0.1 podes rootear sin necesidad de pasarte a 3.1, busca en el foro y vas a encontrar los pasos y las herramientas para hacerlo sin inconvenientes.
En cuanto a si perdes o no la autorización para acceder como root, ya que el root no lo pierdes nunca si lo perdieras no te andaría la tablet, depende de que rom le instales, si te fijas en las caracteristicas de las mismas hay algunas que incluyen acceso al root y otras que son las oficiales que no.
Espero haberte sido util.