Los programas de aida, cpu z y demás, pueden equivocarse en la nomenclatura y datos del SoC, y más si son soc, con pequeñas revisiones (412, 616, 617 etc). Pero bueno, es lo de menos.
En la familia E5s, además del estándar (imagino que es el que tienes), están el E5s Lite y el E5s Essentials, ambos con el SD410, pudiendo ser muy confuso.
http://wintablet.info/2016/10/el-cur...labon-perdido
Ahora, viendo tu caso, es muy extraño, que efectivamente, tengas el E5s con el SD412 (MSM8916T) y en información del teléfono, te ponga MSM8916 equivalente al SD410.
Pero, no eres el único con esta información, sacado de este hilo,
https://www.htcmania.com/showthread.php?t=1158811, el siguiente vídeo:
Min 2:50, donde se muestra la misma información que a tí, el MSM8916 (SD410).
Aún así, no tengo nada claro, podrían ser simples fallos de nomenclatura y realmente tener el SD412 o las hipotesis que comentas. A ver si @
Soporte BQ aclara este tema.