el Clockworkmod es un menú para llevar a cabo tooooodo lo qe tiene que ver con instalar ROMs, Kernels, MODs y demas. Y en efecto, el ROM Manager para eso es.
Pues las ROMs desvodafonizadas son las ROMs directamente de Google, osea, solo traen cosas que son propias del Sistema Operativo, sin nada de las compañias de telefonias, en este caso no se actualizan, las bajas y las flasheas y eso es lo que tienes, no hay mas.
El smartflash es SOLAMENTE para instalar ROMs OFICIALES.
El Clockworkmod es especificamente para instalar Custom ROMs y demas modificaciones, nunca he actualizado por ROM Manager pero supongo que es exactamente lo mismo que el Cwm. Y cuando instalas una ROM Oficial (Stock ROM) si se pierde el Root, en cambio si instalas una Custom ROM ya tiene root integrado y el mismo Recovery, al actualizar a cualquier ROM se borra todos los datos que tu le hayas puesto, aplicaciones, registros del directorio, mensajes, llamadas, etc, etc. Ya que es como si sobreescribieras encima de la ROM que tenias. Para eso haces un Backup con una app que se llama Titanium Backup y cuando instalas la nueva ROM, restauras toda tu informacion ha como estaba antes de. Y te recomiendo que hagas Backups constantemente, yo hago uno cada semana por si se lia algo
No te preocupes, para esto es el foro.
Saludos !