Necesitas:
Drivers adb en el PC, puedes usar los instaladores de 15 segundos, para XP usa la versión 1.3, para los demás cualquiera.
En el móvil activa las opciones de desarrollo y dentro de éstas la depuración USB.
Ahora debes averiguar el nombre exacto del paquete que quieres desinstalar, lo puedes hacer yendo a ajustes/aplicaciones instaladas, le das a los 3 puntos arriba y marcas que muestre los servicios de sistema. Buscas la app que quieres quitar (por ejemplo Chrome) la pinchas y le das a la "i" arriba a la derecha, en la siguiente pantalla te saldrá el nombre del paquete (nombre de APK) apúntalo, en este caso es: com.android.chrome
Conecta el móvil al PC (recuerda tener activa la depuración USB) y déjalo en solo carga. Te pedirá autorización para el PC, dásela.
Nos vamos al PC:
Abre una línea de comandos y ve hasta la carpeta adb en la raíz de tu partición de sistema.
Ejecuta adb devices, si todo es correcto te saldrá el identificador del móvil confirmando la comunicación.
Ejecuta adb shell para acceder al móvil.
Lanza: pm uninstall -k --user 0 "nombre del paquete" (sin comillas)
Repítelo con cada app que quieras desinstalar.
Los APK se mantienen en la ROM, restableciendo a fábrica volverán a aparecer las aplicaciones, no da ningún problema con OTA's y las aplicaciones desinstaladas se mantienen desinstaladas tras actualizar.