Google ha dicho varias veces que hacer root no anula ninguna garantía, ni siquiera es necesario revertir el root para cursarla, salvo que el proceso de rooteo sea la causa de la avería. Esto era así ya con el Nexus 5X, y a mí mismo me pasó: Nexus 5X rooteado y muerte súbita 4 meses antes de acabársele la garantía, no pude revertir nada. Al SAT, y en 10 días, móvil devuelto plenamente operativo, 0€.
Lo de las OTAs es otro tema, que nada tiene que ver con la garantía del terminal. Un móvil rooteado y por tanto con el bootloader desbloqueado, no puede instalar OTAs a la manera fácil, hay que instalarlas manualmente.