Hombre, si ya de paso las formateas mejor, como dice nuestro cocinero en el primer post: "Si tienes problemas con la tarjeta SD, prueba a formatearla usando
SD Formatter 3.0". En cuanto a clonar la partición ext parece que no lo necesitas pero por si acaso, yo también hice un tutorial:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=182256
Básicamente puede hacerse con el gparted, copiar/pegar la partición a clonar, estando en la segunda el mismo espacio pero sin asignar.
Y desde el mismo recovery también se puede haver un backup y luego restaurar la partición ext desde advanced/restore sd-ext.
Saludos!!