Buenas!! Los dos son excelentes teléfonos.
Yo tomaría la decisión en función de si buscas android stock o MIUI y del tamaño.
Los dos son muy buenos en todos sus apartados. Tanto en cámara, batería, rendimiento...
La única pega que le veo al Mi Note 3 es que no se vende oficialmente en España (aunque si hay tiendas que lo dan con garantía).