Da igual la ROM que tengas y si tienes o no root. Lo que si es importante que te guardes lo que creas necesario (fotos, mensajes, etc) porque se borrara todo lo de la Memoria Interna. De la SD no se borra nada salvo que hagas la parte de la SD que es a partir del punto 18 creo recordar.
En cuanto leas el manual lo verás.