Como bien dice el tutorial eso es lo que hay que hacer para realizar una instalación limpia. Esto quiere decir que la Rom cocinada se instala sobre la base de la Rom Original esto es lo mejor para que el teléfono sea 100% estable y no dé un fallo.
Pero bueno, a gusto del consumidor, también puedes instalar la Rom "a lo bruto" desde el recovery sobre cualquier Rom (haciendo previamente Wipe Caché y Wipe Dalvik).
El post de Criskelo dice que no hay que hacer wipe, porque se supone que la Rom la vas a instalar sobre una versión anterior de su Rom, por eso lo de no hacer wipe. Pero si vas a instalar la Criskelo Rom encima de cualquier otra es recomendable siempre hacer wipes, porque si no puede haber problemas de incompatibilidades.
Un saludo