Se soluciona vinculándolos entre sí. Es un rollo pero creo que es la única solución. Si tienes 3 contactos de la misma persona es porque te los pone por separado: su cuenta de gmail, su whatsapp y su cuenta de hotmail.
Entras a la app de contactos y arriba a la derecha, en los 3 puntos, eliges combinar contactos. Así puede que soluciones alguno. Luego, deja pulsado un nombre xxx y a continuación seleccionas los duplicados de ese nombre xxx. Pulsa arriba en los 3 puntos y selecciona vincular. Así uno a uno.