Por ley, quien está obligado a repararlo es el vendedor, no el fabricante. Y sí, si el problema no fue provocado por el root sino que es de hardware tienen que arreglarlo.
Los fabricantes ofrecen una garantía comercial que es vinculante. Si Samsung, en su garantía comercial dice algo de knox no están obligados a repararlo. De todas formas, al menos antes, la garantía comercial de Samsung decía que ase aplicaba en los mismos términos que la legal. Si sigue siendo así también están obligados.
Un saludo.