Eso es, la app Documentos es como un permiso general para poder dar permiso a la sd, por defecto viene deshabilitado, pero cada vez que se apague o reinicie el móvil vuelve a deshabilitarse, hay que tenerlo siempre en cuenta, después como dices la primera vez que utilices una app nueva te pedirá el permiso y una vez que se lo des ya no tendras que volver a dárselo.
Conclusion: la app Documentos hay que tenerla siempre en cuenta y volver a habilitarla si reiniciamos el móvil.