Perdón? Se congelan cuando pasan a segundo plano. Lo único que siguen ejecutando son los servicios que tengan asociados, o te crees que whatsapp sigue ejecutando en segundo plano?
Solo tienes que revisar las tareas y verás que Whatsapp, por poner un ejemplo, tiene un servicio que es el que corre en segundo plano y se encarga, entre otras cosas, de manejar las notificaciones. Estos "servicios" pueden realizar ciertas cosas, como reproducir música, descargar archivos, pero la "aplicación principal asociada" (para entendernos, la dueña del servicio) es congelada por android cuando pasa a background.
