Para calibrar la batería tienes que ser root y hacerlo con una aplicación de calibración de batería siguiendo las instrucciones que te ponga dicha aplicación, hay varias. Hay un fichero donde se guardan los datos de la batería y si ese fichero está corrupto o tiene los datos mal puestos, esta aplicación lo arregla para que el telefono pueda usar el 100% de la batería. Tambien te digo que cada vez que instalas una ROM ese fichero se inicializa y se crea nuevo, entonces tengo mis dudas de que tu problema sea por ese motivo. De todas formas intentalo por si acaso.
Un saludo.