Yo no me preocuparía demasiado.
Al contrario que los discos duros el tiempo de acceso a cualquier parte de la tarjeta es el mismo, eso se traduce en que no importa en qué lugar de la tarjeta (al principio o la final) metes los ficheros, y en cuanto a la fragmentación el descenso de rendmiento es muchísimo menor que en el caso de un disco mecánico donde el cabezal tiene que ir saltando de un lado a otro. En un error ponerse a desfragmentar una memoria cada 2x3 porque esta tiene un número limitado de operaciones de escritura y se estropearía en poco tiempo, además los programas de desfragmentación no suelen estar optimizados para este tipo de medios. Lo mejor si tras mucho tiempo de borrar y escribir notais cierto descenso de rendmiento es: mover TODO el contenido de la sd al pc y luego hacer el paso inverso, volver a moverlo del pc a la sd, así incluso tardaréis menos que desfragmentando.
Buen apunte cooker, eso no lo sabrá mucha gente: que se puede entrar al market desde el pc, seleccionar una app y decirle que se instale en uno de nuestros aparatos android. Es curioso ver cuando vamos a coger el móvil que esta app se ha instalado automáticamente .