Entras en Ajustes--->Cuentas y sincronización---> En el apartado "Gestionar cuentas" figuran las cuentas de gmail, facebook, whatsapp, etc que has configurado. Pulsas con el dedo sobre la cuenta que quieres eliminar y te lleva a otra pantalla donde puedes marcar lo que quieres sincronizar o no de dicha cuenta y, abajo de todo, hay un botón que dice "eliminar cuenta". Le das y te elimina dicha cuenta del móvil.