Las veriosnes Nightly son las versiones en desarrollo, están en cambio constante, sin estabilidad confirmada, y son para que la comunidad vaya probando los cambios y reportando fallos, etc.
No tienen por qué dar problemas, pero los desarrolladores recomiendan que sólo las utilicen usuarios avanzados.
Normalmente, si eres de las personas que están constantemente cambiando ROM, probando historias y tal no tendrás problemas con la Nightly, pero si lo que quieres es poner una ROM estable y dejarte de historias y problemas, pon la estable.
Saludos!