kizas sea por la extension, mira, prueba una cosa (te lo digo por ke la extension sera lo que no pille, ya que los mkv hd que tengo, todos son m2ts dentro del contenedor y si se ven):
cogete el mkv merge y crea un mkv con ese m2ts (tarda 1 minuto)
y mete el mkv dentro del movil, seguro que te va.