A veces ese tipo de manchas se dan porque la batería se está hinchando. Yo tuve un iPhone 5S al que le pasó y aparecieron ese tipo de manchas en la pantalla debido a la presión de la batería hinchada.
Si tienes problemas de batería, eso puede ser el causante. Si la batería te funciona correctamente, probablemente no tenga nada que ver.